مجلس الجامعة
وهو أعلى سلطة وهيئة علمية وإدارية في الجامعة، ويتولى إدارتها، وتحديد الأهداف، ووضع الاستراتيجيات، ورسم السياسة العامة، وإقرار الخطط، ومتابعة تنفيذها، ويمارس جميع الحقوق والصلاحيات؛ لتسيير عمل الجامعة، وتحقيق الأهداف المطلوبة، وينعقد مجلس الجامعة مرة واحدة في الأقل كل شهر، ولرئيسه أن يدعوه إلى اجتماع ‏استثنائي عند الضرورة أو بناء على طلب خطي من ثلث عدد أعضائه، ويتم النصاب ‏بحضور ثلثي أعضائه، وتتخذ القرارات والتوصيات والمقترحات بأغلبية عدد ‏الحاضرين، وعند تساوي الأصوات يرجح الجانب الذي فيه الرئيس.

ويتكون من السادة الأعضاء 
ت الاسم الثلاثي واللقب المنصب في مجلس الجامعة مكان العمل التخصص
1 أ.د. نورس محمد شهيد الدهان رئيس المجلس رئيس الجامعة دكتوراه فيزياء / فيزياء نووية
2 د. جاسم سعد الابراهيمي عضواً-ممثل الجهة المؤسسة للجامعة (مؤسسة النجف الخيرية المملوكة للعتبة العباسية المقدسة) كلية طب الاسنان دكتوراه طب عام / طب الاسرة
3 أ. م. د. نوال عائد الميالي
عضواً مساعد رئيس الجامعة للشؤون العلمية
دكتوراه في الشريعة/ العلوم الاسلامية
4 أ.د. علي صاحب طالب علي الموسوي عضواً رئيس قسم السياحة الدينية وكالة دكتوراه جغرافية
5 أ.د. عائد كريم علوان الحريزي عضواً رئيس قسم الاعلام وكالة دكتوراه اللغة العربية/النحو والصرف والعروض
6 أ.د. يحيى كاظم محمد نجم السلطاني عضواً عميد كلية التقنيات الطبية والصحية دكتوراه /فسلجة طبية
7 أ.م.د. محمد داخل مطرود آل يوسف عضواً عميد كلية الصيدلة وكالة دكتوراه صيدلة/ صيدلة سريرية
8 م.د كريم مكطوف عطية الغانم عضواً عميد كلية طب الأسنان وكالة
ممثل التدريسيين
دكتوراه طب أسنان/ طب الفم
9 أ.م.د. أحمد علي عبود الخفاجي عضواً عميد كلية القانون وكالة دكتوراه في القانون العام/ القانون الدستوري
10 أ.م.د. نصير قاسم حمودي الباجة جي عضواً عميد كلية الهندسة التقنية وكالة دكتوراه هندسة كهربائية وألكترونية / هندسة قدرة
11 م.د. حسام علي حسن العبيدي عضواً رئيس قسم الشريعة دكتوراه فلسفة/  فلسفة الدين والفكر الاسلامي
13 م.د. حيدر محمد حسن المخزومي أمين المجلس قسم الشريعة دكتوراه لغة عربية
14 م.د. حيدر جميل حياوي العبودي مقرر المجلس مقرر في قسم الاعلام دكتوراه جغرافية/ جغرافية سياحة واثار
 
مهام المجلس
يمارس مجلس الجامعة جميع الاختصاصات المحددة في القانون رقم (25) لسنة ‏‏2016م ، وعليه يتولى مجلس الجامعة ‏المهام الآتية:‏ ‏
•    إقرار شروط القبول.‏ ‏
•    تحديد إعداد الطلبة المقترح قبولهم في بداية كل سنة دراسية.‏
•    إقرار المناهج الدراسية بعد إقرارها من قبل اللجان العلمية ذات العلاقة.‏
•    إقرار خطة توفير مستلزمات التعليم.‏
•    تحديد الأجور الدراسية.
•    ادارة اموال الجامعة واستثمارها والتصرف بها وفقاً لاهداف الجامعة.
•    اعارة اعضاء الهيئة التدريسية وتمديد مدة الاعارة وانهائها.
•    التوصية بفتح كلية ضمن الجامعة ورفعها الى الوزارة.
•    إقرار الترقيات العلمية لأعضاء الهيئة التدريسية.
•    منح الخرجين الشهادات العلمية.
•    إقرار ملاكات الجامعة والكليات والأقسام العلمية.
•    إقرار التعاقد مع الأساتذة العراقيين والأجانب وفق الضوابط المعتمدة في الجامعات ‏الرسمية بأستثناء تحديد الاجور.
•    المصادقة على تعيين أعضاء الهيئة التدريسية والموظفين وتحديد أجورهم ومكافآتهم وقبول استقالاتهم وإنهاء خدماتهم.
•    تعليق الدراسة كلياً أو جزئياً عند اقتضاء الأمر مدة لا تتجاوز أسبوعاً واحداً، وعلى ‏أن تُعلَم الوزارة بذلك مع بيان الأسباب والمبررات.
•    إهداء الأموال المنقولة إلى الجامعات والمؤسسات العلمية والتربوية.
•    قبول المنح والهبات والإعانات والوصايا والوقف من داخل العراق ‏وخارجه.
•    التوصية بفتح الأقسام العلمية أو دمجها أو إلغائها.
•    مخاطبة جميع مؤسسات الدولة ودوائرها الرسمية وشبه الرسمية والمؤسسات ‏غير الرسمية بما يحقق أهداف الجامعة.
•    المصادقة على فصل الطالب من الجامعة فصلا نهائياً أو مؤقتاً بناءً على توصية الكلية او القسم العلمي الذي يتبعه الطالب وقرار رئيس الجامعة.
•    لمجلس الجامعة تخويل بعض مهامه الى رئيس الجامعة.